Село Трефиловка входит в состав Ракитянского района Белгородской области.

Основано как село с поселением экономических крестьян Знаменского Хотмыжского монастыря.

В 1780-1796 годы входило в состав Хотмыжского уезда Харьковского наместничества. С 1796 по 1917 годы в составе Грайворонского уезда Курской губернии.