В конце XVIII – первой половине XIX вв. деревня Трубеж входила в приход Архангельской церкви с. Усланки Обоянского уезда.

В 1868 г. тщанием прихожан в Трубеже был построен храм. Его освятили во имя архистратига Михаила. В документах Курской епархии он значится под названием Михайловский, Михайло-Архангельский.

К приходу Михайло-Архангельского храма, кроме с. Трубеж, относилась л. Анахина. В 1915 г. в с. Трубеж было 185 домов, в них 640 мужчин, 615 женщин, в д. Анахиной – 72 дома, в них 319 мужчин, 300 женщин. Церковь имела 2 десятины земли пол усадьбой и погостом, 39 десятин пахотной земли и 1 десятина 1000 кв. саженей сенокосной. Часть их была подарена храму прихожанами.

В документах за 1920 г. имеется описание храма: здание его деревянное на каменном фундаменте, одноэтажное, в одной связи с двухъярусной колокольней. Шесть глав храма покрыты белой жестью, кресты железные гладкие. Размеры храма 33 × 16 аршина. имеется 14 окон с решетками, 4 двери. Паперть закрытая. На коло¬кольне 7 колоколов: 77 пудов 37 фунтов, 39 пудов 3 фунта, 15 пудов, 6 пудов, 3 пуда 19 фунтов, 1 пуд 26 фунтов. 1 пуд. Храм находился в каменной ограде с одним входом. Возле него располагалось сельское кладбище. Отмечалось хорошее состояние росписей и иконостаса — он был деревянный, золоченый, трехъярусный, размером 15 × 12 аршин с тридцатью иконами. Сооружен в 1868 г., поновлен в 1909 г. При церкви с 1887 г. действовала церковно-приходская школа, помещавшаяся в деревянном доме вместе с сторожкой. В библиотеке школы имелось 20 книг. В 1915 г. в школе обучались 120 мальчиков и 40 девочек.

Ближайшими к церкви Трубеж храмами были Ильинский сл. Казацкой и в 2,5 верстах, Пантелеймоновский с. Нижнее С       олотино в 2 верстах, Архангельский с. Усланки в 4 верстах.

После выхода в свет декрета СНК РСФСР от 23.02.1918 г. храм продолжал действовать в соответствии с уставом и типовым договором. В 1922 году было изъято 16 предметов (священные сосуды, кресты) общим весом 8 фунтов 62 золотника, но часть предметов была заменена на собранный прихожанами лом серебра.

Храм был закрыт  в 1940 году как не действующий с 1931 года. Богослужение возобновилось с 6 мая 1942 года. С 1944 года священником в это время здесь был Климов Нефед. 2 октября 1945 г. был заключен договор о приеме здания церкви в бессрочное бесплатное пользование гражданами с. Трубеж.

В 1950 г. здание с согласия епископа Нестора было занято для временного использования под зерносклад колхозом им. Карла Маркса. После освобождения от зерна оно пустовало. В августе 1951 г. верующие обратились к уполномоченному Совета по делам РПЦ с просьбой о возвращения здания.

В 1951 г. осмотр технического состояния здания показал, что фундамент дал незначительную усадку. Это привело к деформации здания и значительному наклону купола, состояние его было оценено как угрожающее.

30.11.1951 г. последовало решение Совета по делам РПЦ при СМ СССР об изъятии здания церкви от общины верующих с. Трубеж. Лишь в 1989 г. граждане с. Трубеж воссоздали религиозную общину.

Документы церкви в Государственном архиве Курской области: клировая ведомость за 1915 г.; метрические книги за 1876, 1879 гг.

Церковь Св. Михаила Архангела включена в «Список выявленных объектов культурного наследия, представляющих историческую, научную, художественную или иную культурную ценность».